Mailbox Manager ist eine Anwendung, um in nur einem Schritt mehrere POP3-Mailfenster zu bearbeiten, wie z.B.
Mailfenster auf die man über E-Mailanwendungen wie Eudora, Outlook Express o.ä. oder über den Browser Zugriff hat bevor man die Mail herunterlädt. Man kann sowohl nur Teile der Mail als auch die ganze Mail anschauen und auf diese Weise unerwünschte Mails frühzeitig entdecken, wie z.B. SPAM-Mails oder mögliche von Viren befallene Anhänge. Hier bietet Mailbox Manager die Möglichkeit, diese sofort zu löschen. Beim Verlassen des Mailbox Managers, kann die E-Mailsoftware automatisch ausgeführt werden, um die restlichen Mails herunterzuladen (oder der Browser wird automatisch an ein E-Mailprogramm online angeschlossen). Auf diese Weise schafft es kein Virus oder sonstige Bedrohung bis auf Ihren Computer. Wenn Sie andererseits E-Mailadressen haben, die NIE in den Spamordner verschoben werden oder als Virus klassifiziert werden sollen, kann man diese in die White List Database – oder sichere Datenbank – eintragen und der Mailbox Manager wird diese Adressen auf der Suche nach SPAMS überspringen.

Das Programm unterstützt den vorprogrammierten Mailscan. Jedes E-Mailkonto kann blockiert werden, auch wenn mehrere Anwender dieses Programm auf ein und demselben Computer teilen, so dass seine Daten nur dann verändert werden können, wenn man das korrekte Passwort eingibt.